贵州腹腔菌属一新种——大假单胞菌

一、贵州省腹袋属一新种——巨盘腹袋吸虫（论文文献综述）

许姝歆^[1]（2019）在《中国西南喀斯特地域淡水蟹类的物种多样性及分子系统地理学研究》文中研究表明目的:1.基于16S rRNA基因建立分布于中国西南喀斯特地域淡水蟹物种的系统发生树,探讨与确立中国淡水蟹类地理区划分区单元与西南喀斯特地貌的关系。2.基于作者采集和南昌大学基础医学院淡水十足目甲壳动物与并殖吸虫研究室标本库所保藏的西南八省区的31属129物种合计640个淡水蟹类个体,由此构建西南喀斯特地域淡水蟹类地理信息系统（GIS）,旨在寻找喀斯特地貌与淡水蟹类物种的分布方式及物种多样性间可能存在的内在规律。3.测定中国西南喀斯特地貌溪蟹科下7属7种淡水蟹线粒体基因组,并进行系统发生分析以及比较线粒体基因组学研究,尝试厘清中国西南喀斯特地貌淡水蟹类的分子系统发育关系,推演该地域淡水蟹类属、种可能的分化年代。方法:1.基于对西南喀斯特地域淡水蟹类形态分类及其分子亲缘的初步研究,样点的选择以淡水蟹类“种”为基准,依据喀斯特地貌特征来确定标本的具体采集地点,作者与研究团队按照课题计划前往拟定的地点进行标本采集,并统计研究室标本库历年已在西南喀斯特地域采集保存的淡水蟹类标本一同用于本项目研究。对所选取的标本在与模式标本比对的基础上进行形态学鉴定,记录标本采集样点的经纬度等,并对其是否处于喀斯特地貌加以区分。2.对样本进行DNA的提取与16S基因的扩增及测定,并检索NCBI数据库,下载分布于西南八省区且具有16S基因的物种序列,联合本实验测得的序列建立基于16S基因的系统发生分析树。3.基于喀斯特科学数据中心（www.karstdata.cn）提供的中国南方喀斯特空间分布数据,通过地理信息系统（GIS）构建中国西南喀斯特地域八省区淡水蟹类物种分布图。4.获取中国西南喀斯特地域下7属7种淡水蟹线粒体全基因组,分析其基因组组成、基因排列顺序、tRNA结构及密码子使用情况等,并联合其他短尾下目物种的13个蛋白质编码基因进行系统发生分析以及分歧时间估算。结论:1.中国大陆现有淡水蟹类共计2科48属324种,其中85.42%的属和60.49%的种集中分布在西南八省区。2.基于16S基因序列进行的系统发生分析结果显示所有淡水蟹基本以属为单位形成了各自的分支,且分布于云南省的物种形成了一条独立的进化支,且其中的大部分物种仅为云南省特有。3.对于基于16S基因构建的系统发育树,基因间隔消失的现象时有出现,尤其龙溪蟹属下物种的种间分类情况较不理想。4.通过对西南各八省区内淡水蟹地理信息系统的分析表明,以省/市/自治区为单位淡水蟹物种的分布及多样性与喀斯特地貌无显着关联。5.气候、纬度及喀斯特地形在淡水蟹的形成、生存和分化过程中均具有重要作用。其中,气候和纬度决定了淡水蟹是否具有适宜生存的环境,而喀斯特地形则在淡水蟹的物种分化过程中起到了重要作用。6.分布于中国西南喀斯特地域下7属7种溪蟹科淡水蟹类的线粒体基因组全长在19,236 bp（相似非拟溪蟹）至16,547 bp（镜头华石蟹）之间。所有物种均包含后生动物线粒体基因组典型的37个基因和一个控制区,且核苷酸组成均表现出明显的AT偏向性。7.在本次测序的7个物种中,兴安内陆溪蟹和灵川博特溪蟹的线粒体全基因组出现的了异常的tRNA基因（tRNA-Ile和tRNA-Met）。8.与泛甲壳动物原始排列顺序及其他淡水蟹类的基因排列顺序相比,在兴安内陆溪蟹和灵川博特溪蟹中发现了一种全新的基因排列方式,其中包含了两个蛋白质编码基因包括COX1基因的重排,这在短尾下目物种中是非常罕见的。9.基于短尾下目物种线粒体基因组的13个编码蛋白基因建立的ML树和BI树表现出相似的拓扑结构,具有较高的置信度,分析结果与当前主流的物种分类体系趋于一致。10.基于13个编码蛋白基因的分歧时间估算结果显示淡水蟹的分化时间为113.3008 Ma,拟地蟹总科与溪蟹总科分化于74.8013 Ma。11.墨脱近溪蟹与相似非拟溪蟹的分化时间与青藏高原和云贵高原形成的时间相吻合,提示墨脱近溪蟹与相似非拟溪蟹可能来自共同祖先,由于横断山脉的发育造成的地理隔离从而促成了物种的分化。12.分布于中国西南喀斯特地貌下的7个物种的分化时间基本均早于其余地区的淡水蟹物种,表明分布于喀斯特区域的淡水蟹有着更为古老的历史,可能为中国大陆部分淡水蟹类的祖先,而中国西南喀斯特地区,尤其以云贵高原区域为主的喀斯特区域可能是为中国大陆部分淡水蟹的发源地。

黄德生,李绍珠^[2]（2003）在《云南省家畜家禽寄生虫名录(五)》文中认为

苗西明,周道金,潘晓条,裴乃亮^[3]（1998）在《贵州省腹袋属一新种——巨盘腹袋吸虫》文中认为在鉴定我县耕牛寄生虫区系调查吸虫标本时,发现了同盘科、腹袋亚科、腹袋属一新种,以其腹吸盘巨大特征而命名为巨盘腹袋吸虫（Gastrothylax magnadiscus sp.nov.）虫体中型,活体时呈暗红色,酒精保存后呈灰白色,虫体部最大宽度在中部,腹吸盘大于体宽,外翻似帽状。前端呈圆锥形,电镜扫描具有横走向的皱纹和乳头。根据15个染色标本测量结果:体长9.8～12.5mm（11.15）.体宽3.1～6.2mm（4.65）,体宽与体长之比1:2.40.腹袋开口于口吸盘和肠分叉之间,后缘

钱德兴,苗西明,杜玉磐,龙鳌,曾红^[4]（1998）在《巨盘腹袋吸虫成虫的超微结构观察》文中进行了进一步梳理水牛自然感染巨盘腹袋吸虫（Ｇａｓｔｒｏｔｈｙｌａｘｍａｇｎａｄｉｓｃｕｓｓｐ．ｎｏｖ）成虫在扫描电子显微镜下，可见虫体体表具有环行横纹、凹窝和大小不等、形状不一的泡状结构及息肉样圆突，没有小棘。横纹在腹袋口与腹吸盘之间较致密，排列规则，在虫体前端发生不规则的间断，形成息肉样结节。泡状结构多分布在口吸盘周围，为单生，以柄与体壁相连，似水泡状，其表面无纤毛；分布在其它部位的泡状结构多为簇生；体后１／３没有泡状结构。腹袋口周围的体壁如海绵状，无泡状结构，周围布满息肉样结节。

钱德兴,龙鳌,杜玉磐,曾红,杨溶生,苗西明,龙文波^[5]（1997）在《水牛自然感染巨盘腹袋吸虫病的病理形态学观察》文中提出１７例自然感染巨盘腹袋吸虫的水牛，剖杀前表现消瘦，贫血，下颌水肿；剖杀后可见肝脏肿大，膈面和脏面粗糙，被膜增厚，散在出血点。瘤胃粘膜脱落，有出血斑或出血点，并有大量成虫寄生。真胃有出血点，粘膜脱落。小肠粘膜表面有充血区和出血斑点。组织学检查见肝小叶间质增生、增厚，胆管、胆囊壁增厚，上皮细胞变性坏死，肝细胞分别发生局灶性坏死、点状坏死或广泛性坏死，窦状隙有大量的炎症细胞。瘤胃上皮细胞坏死脱落，表层角质化明显，固有层胶原纤维玻璃样变，血管充血、扩张，有大量炎性细胞浸润。小肠粘膜上皮细胞增生、坏死、脱落，粘膜下层毛细血管充血，固有膜内有多量炎性细胞浸润，肌纤维玻璃样变，肌间水肿，肠腺大量增生。在肝、真胃和小肠的组织切片中见有不同发育阶段的童虫。

钱德兴,苗西明,杜玉磐,龙鳌,曾红龙,文波^[6]（1997）在《耕牛巨盘腹袋吸虫感染情况调查》文中指出对贵州省３８个县６３３个乡（镇）的１１２１头耕牛（黄牛３６６头，水牛７５５头）用蠕虫学局部剖检法在其中４５头牛的瘤胃内检出巨盘腹袋吸虫（Ｇａｓｔｒｏｔｈｙｌａｘｍａｇｎａｄｉｓｃｕｓｓｐ．ｎｏｖ．），总感染率为４．０１％，在不同性别的黄牛、水牛无显着差异，而与年龄呈正相关。该吸虫的感染有明显的季节性和地域性，主要分布于潮湿低洼地区。另剖检７６８只山羊和９１只绵羊，均未发现该吸虫感染

刘贵^[7]（1997）在《贵州省畜禽寄生虫病调查》文中研究表明贵州省兽医防治检疫站钱德兴、杜玉盘等报告,贵州省畜禽寄生虫区系调查时,共获省内新纪录125种,国内新纪录2种,世界新种1种,世界新宿主1种,12种虫体的国内新宿主。1、国内首次报道的有:角额膜壳绦虫（寄生于2只鸭小肠内）、格蓝膜钩绦虫（寄生于13只鸭小肠内）。2、国内检出虫

钱德兴,苗西明,周静仪^[8]（1997）在《贵州省腹袋属一新种记述（吸虫纲:同盘科）》文中进行了进一步梳理本文记述寄生于贵州省丹寨县水牛瘤胃内同盘科腹袋亚科腹袋属内吸虫的一个新种，巨盘腹袋吸虫Gastrothylaxmagnadiscussp．nov.，简述了该属的简史，并将新种与该属已有的种类的主要特征列表进行了比较。

钱德兴,杜玉磐,毛银选,曾红,何定国,肖耀南,苗西明,阮正祥,陈能桥,朱凤云,王道地^[9]（1997）在《贵州省畜禽寄生虫区系调查总结报告》文中研究指明

王溪云,李敏敏,彭吉生,周静仪,王小红^[10]（1996）在《昆明牛同盘科吸虫及一新种记述》文中提出对云南省昆明市约４０头水牛和黄牛瘤胃内的同盘科吸虫进行了分类鉴定，确定为２亚科６属２０种，其中１种为新种，定名为华云殖盘吸虫新种Ｃｈｔｙｌｏｐｈｏｒｏｎｈｕａｙｕｎｉｓｐ．，ｎｏｖ，另７种为云南省新记录。

二、贵州省腹袋属一新种——巨盘腹袋吸虫（论文开题报告）

（1）论文研究背景及目的

此处内容要求：

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例：

本文主要提出一款精简64位RISC处理器存储管理单元结构并详细分析其设计过程。在该MMU结构中,TLB采用叁个分离的TLB,TLB采用基于内容查找的相联存储器并行查找,支持粗粒度为64KB和细粒度为4KB两种页面大小,采用多级分层页表结构映射地址空间,并详细论述了四级页表转换过程,TLB结构组织等。该MMU结构将作为该处理器存储系统实现的一个重要组成部分。

（2）本文研究方法

调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

三、贵州省腹袋属一新种——巨盘腹袋吸虫（论文提纲范文）

（1）中国西南喀斯特地域淡水蟹类的物种多样性及分子系统地理学研究（论文提纲范文）

摘要

abstract

第一章引言

1.1 中国西南喀斯特地域特征概况

1.1.1 西南喀斯特的分布及特征

1.1.2 生物喀斯特

1.1.3 西南喀斯特的生物多样性

1.2 中国西南喀斯特地域淡水蟹类的物种多样性

1.3 中国大陆淡水蟹类的研究进展

1.3.1 形态学方面的分类研究

1.3.2 分子水平的分类研究

1.3.3 短尾类系统发生分析概况

1.3.4 线粒体基因组在短尾类中的研究概况

1.4 地理信息系统(GIS)研究概况

第二章中国西南喀斯特淡水蟹类的分布格局的探讨及地理信息系统(GIS)的构建与初步应用

2.1 实验材料

2.1.1 样本采集与保存

2.1.2 形态学分类与鉴定

2.1.3 主要实验仪器和设备

2.2 实验方法

2.2.1 DNA的提取

2.2.2 PCR扩增

2.2.3 数据选择与分析

2.2.4 系统发生分析

2.2.5 地理信息系统分析

2.3 实验结果

2.3.1 形态学分类鉴定

2.3.2 系统发生分析

2.3.3 基于地理信息系统分析淡水蟹类的分布格局

2.4 讨论

第三章中国西南喀斯特地域7属7种淡水蟹线粒体全基因组分析

3.1 实验材料

3.2 实验方法

3.2.1 测序、组装和注释线粒体基因组

3.2.2 系统发生分析

3.2.3 分歧时间估算

3.3 实验结果

3.3.1 凯里龙溪蟹Longpotamon kenliense

3.3.2 茂兰中国溪蟹Chinapotamon maolanense

3.3.3 相似非拟溪蟹Aparapotamon similium

3.3.4 镜头华石蟹Sinolapotamon patellifer

3.3.5 兴安内陆溪蟹Neilupotamon xinganense

3.3.6 灵川博特溪蟹Bottapotamon lingchuanense

3.3.7 宽腹小石蟹安顺亚种Tenuilapotamon latilum anshunense

3.3.8 线粒体基因组组成及分析

3.3.9 基因重排分析

3.3.10 系统发生的分析

3.3.11 分歧时间估算

3.4 讨论

第四章结论

致谢

参考文献

攻读学位期间的研究成果

综述