肉牛群体遗传变异的微卫星多态性分析

肉牛群体遗传变异的微卫星多态性分析

一、肉牛群体遗传变异的微卫星多态性分析(论文文献综述)

张显波,傅建军,胡锦丽,朱文彬,闵倩雯,赵飞,吴俣学,董在杰[1](2021)在《基于D-loop序列和SSR的从江田鱼与6个鲤群体的遗传分析》文中指出【目的】探明从江田鱼的遗传背景及其多样性水平,为进一步开展系统选育提供数据参考。【方法】采用D-loop序列和11个SSR标记开展从江田鱼(CJTY)与清水江鲤(QSJ)、太湖鲤(THL)、黄河鲤(HHL)、黑龙江鲤(HLJ)、福瑞鲤(FRL)及松浦镜鲤(SPL)等6个鲤群体的遗传分析。【结果】长度为932 bp的D-loop片段上有46个多态性位点,共定义41个单倍型,其中CJTY有16个单倍型;CJTY的核苷酸遗传多样性π值为0.005,单倍型多样性Hd为0.829,高于FRL和SPL,但低于其余4个鲤群体,CJTY的多态信息含量(PIC)为0.82,高于FRL(0.73)和SPL(0.50),但低于其他4个鲤群体,CJTY的期望杂合度(He)为0.90,低于QSJ(0.93)和THL(0.92),高于其他4个鲤群体;遗传分化指数(FST值)显示CJTY与QSJ、THL、HHL、HLJ的分化程度较低,与FRL呈中度遗传分化,与SPL呈高度遗传分化,FRL和SPL各为1个亚群,其余5个群体为1个亚群;群体间遗传距离分析结果与FST结果相符。【结论】从江田鱼的遗传多样性水平高于2个人工选育群体(FRL和SPL),低于4个野生群体(QSJ、THL、HHL和HLJ);从江田鱼具有相对独立的地理分布区域和特定养殖模式等特点,受到一定程度自然选择或人工选择压力,但未经系统选育实践,尚保留较高遗传多样性水平,具有进一步遗传改良的潜力。

房瑞新,田雪琪,邹晨,董依萌,刘欣,邢秀梅[2](2021)在《马鹿的起源进化与遗传多样性研究进展》文中研究说明马鹿是非常重要的物种资源,由于栖息地的流失和人为干扰进行近亲繁殖等导致野生马鹿数量急剧减少,而家养马鹿多经过改良,因此马鹿的纯种数量锐减。对马鹿进行分子遗传学研究不仅可以加深人们对马鹿起源和物种形成的认识,还能帮助开展遗传多样性保护研究。随着高通量测序技术、分子生物学和生物信息学的迅速发展,马鹿的起源进化研究已发展到全基因组水平,并取得了一定的成果。马鹿的起源进化研究从最初对体态外貌和染色体核型的研究逐渐发展到对DNA序列与生理指标的研究。文章回顾了近年来国内外对马鹿起源进化和遗传多样性方面的研究,从起源时间、起源地和迁徙路线等方面揭示了马鹿的演化历史,介绍了父系、母系和常染色体研究方面分析了马鹿遗传多样性选取的不同分子标记,为进一步揭示马鹿种群的遗传变异、分化情况、迁徙路线和系统发育关系等提供基础信息,同时为马鹿遗传资源的利用和保护以及马鹿产业的良性发展提供重要的借鉴与参考。

罗宇婷,方弟安,周彦锋,徐东坡,彭云鑫,彭飞,张桂宁,刘凯,尤洋[3](2021)在《基于微卫星标记对长江下游鲢遗传多样性现状的分析》文中提出为了解长江下游鲢(Hypophthalmichthys molitrix)遗传多样性和遗传结构分布,该研究利用微卫星分子标记结合毛细管电泳技术,通过对2017—2019年长江湖口、安庆、芜湖、当涂、镇江、靖江、张家港和常熟8个江段鲢野生群体共327份DNA进行基因分型与遗传多样性相关分析,比对了其遗传多样性、遗传分化和遗传结构情况。结果显示,长江下游8个群体总体遗传多样性水平较高,但群体内缺乏足够的杂合子,8个群体等位基因数(Na)介于6.0~12.3,有效等位基因数(Ne)介于3.94~6.10,观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别介于0.617~0.719和0.658~0.774,无偏期望杂合度(uHe)介于0.671~0.782,Shannon’s信息指数(I)介于1.38~1.86,群体内近交系数(F)介于0.001~0.174;遗传分化分析显示Fst (F-statitics values)介于0.006~0.068,基因流(Nm)介于3.41~41.9,遗传距离(D)介于0.001~0.106,湖口群体与其他群体表现出中等程度的遗传差异,其他群体间遗传差异很小,分子方差分析显示变异主要来自群体内(97.6%);遗传结构分析显示湖口群体有不同于其他群体的基因库。结果表明江湖连通性可能对于鲢在湖口江段展现独特遗传分化特征具有积极意义,而形成这种种群分化究竟是由于地理距离的空间隔离还是生境差异的生理屏障有待进一步探究。

陈宏,黄永震,雷初朝[4](2021)在《郏县红牛的分子育种研究与高效选育》文中认为本文围绕郏县红牛肉用性状的高效选育,分析了郏县红牛种质资源特性与现状,综述了郏县红牛分子育种研究进展与成就,在此基础上,提出了郏县红牛高效选育的实施和措施。首先必须坚持进行郏县红牛的本品种选育,其次是利用已取得的在分子育种方面的研究成果,开展高效选育。在选育和扩群的基础上提出了郏县红牛遗传利用的原则和方法。

朱磅强,何俊,曾青华,张跃博[5](2021)在《动物杂种优势利用及其预测方法》文中进行了进一步梳理杂种优势因具有提高两个不同亲本的遗传组成杂交所产后代的生产性能、生活力和抗逆性等特点,被广泛地运用在动植物杂交育种中。杂种优势利用率越高,种畜产生的价值越高,其后代产生的额外利润就越大。因此,杂种优势的利用率是广大育种工作者所关注的一项重要内容。杂种优势利用率的评估则依赖于对种畜杂种优势大小的预测。本文主要从杂种优势利用和杂种优势预测方法 2个方面对已有的研究进行综述,并探讨有关杂种优势预测准确度提高的方法,以期对相关的研究提供一定的参考和帮助。

刘敏[6](2021)在《建昌马和安宁果下马的遗传多样性及7个体高候选基因单核苷酸多态性分析》文中研究说明

何荣荣[7](2021)在《五种商业酵母在贺兰山东麓赤霞珠葡萄酒工业生产中的定殖情况》文中进行了进一步梳理

徐杰杰[8](2021)在《暗纹东方鲀全基因组微卫星标记的开发及应用》文中研究表明

杨速,操勇清,顾丽红,李丽,曾涛,沈军达,田勇,李国勤,陶争荣,陈黎,毛长国,卢立志[9](2021)在《基于微卫星标记的7个番鸭群体遗传多样性分析》文中进行了进一步梳理为探讨不同番鸭群体遗传多样性和亲缘关系,本研究选取24对微卫星引物,对7个番鸭群体的DNA片段进行PCR扩增及毛细管电泳产物信息检测。结果表明,24个微卫星位点在7个番鸭群体上共检测到80个有效等位基因,基因流(Nm)为2.418 1,多态信息含量(PIC)为0.456 1,F-统计量(F-statistic)平均为0.093 7。7个番鸭群体中,福建花羽番鸭遗传参数较高,海南嘉积鸭遗传参数较低,温州麻步番鸭和法国巴巴里番鸭遗传距离最近(0.020 9),福建花羽番鸭和法国巴巴里番鸭遗传距离最远(0.164 1)。聚类分析结果显示,7个番鸭群体被分为3个类群,余姚花羽番鸭、余姚白羽番鸭、温州麻步番鸭和法国巴巴里番鸭为一个类群。综上所述,7个群体的遗传多样性呈现中度水平,其中福建花羽番鸭遗传多样性较高,海南嘉积鸭较低;群体间呈现中度分化,有频繁的基因交流;地理群体间存在一定的遗传分化。

姜馨[10](2021)在《阜阳地区安徽白山羊体重与体尺相关性及其遗传多样性分析》文中研究指明背景:我国肉羊的养殖历史源远流长,历经上千年的驯养、进化和选育,保留有很多优良的肉羊品种。自2010年起,我国肉羊的养殖量虽稳定增加,出栏量和羊肉产量呈快速增长的趋势,但是存在肉羊生产效率低、羊肉在肉类市场中所占份额极低、羊肉的供给量显着低于需求量、饲养条件受限制、进出口贸易逆差越来越大等多方面的发展现状。另外,阜阳地区纯种安徽白山羊急剧减少,而与波尔山羊杂交多代后的杂交羊却出现了免疫力、对粗饲料的耐受能力和繁殖力下降等情况。多年来,经过多家企业对本地纯种安徽白山羊的保种扩繁等,其种公羊和种母羊的存栏量均有显着增加,为本地安徽白山羊的品种保护和繁育提供了一定的帮助。本实验为推断适合在阜阳地区饲养的山羊,评价阜阳地区山羊的饲养水平以及评估阜阳地区山羊遗传变异和种群结构情况,分别进行了阜阳地区安徽白山羊的体重与体尺相关性及其遗传多样性分析。方法:(1)通过对阜阳地区安徽白山羊体重和体尺性状各项指标的测量与统计,分别根据性别与月龄分类、整理数据,然后运用SPSS26.0分析软件对数据中的体重与体尺性状各项指标之间计算平均值与标准误,进行多重比较以及相关性分析、一元回归分析和多元回归分析等,研究其生产性能增长规律。(2)采集健康的阜阳地区45只安徽白山羊和45只波尔山羊的颈静脉血样,通过提取基因组DNA、引物设计、PCR扩增、序列分型,获取等位基因的片段长度并分类、整理数据,进行90个样本在8个微卫星位点的遗传多样性和遗传分化研究。结果:(1)阜阳地区安徽白山羊的体重、体尺性状各项指标随着月龄的增加而增长,公羊的体重、体尺性状各项指标(尻宽除外)明显比母羊高。另外,阜阳地区安徽白山羊的体重与体尺性状各项指标呈正相关。通过对体重(y)与体高(x1)、体斜长(x2)、胸围(x3)、管围(x4)、尻宽(x5)的多元回归分析,建立了多元回归方程:y=-51.453+0.067x1+0.321x2+0.530x3+0.979x4+0.842x5。(2)阜阳地区安徽白山羊和波尔山羊等位基因的片段长度、等位基因丰富度和基因频率各有不同,TNA与NEA的差额极大,?(SD)、He(SD)、Ho(SD)、PIC(SD)均大于0.5,2个山羊品种的Fst(SD)、Fit(SD)和Fis(SD)差异极显着(P<0.001),两个山羊品种等位基因的差异程度高,8个微卫星位点呈现高度多态性,两个山羊品种遗传结构丰富,且两个种群间的遗传分化的显着性高,两个品种各自都有很高的遗传多样性。安徽白山羊中的TNA、MNA、NPA、AR、?、He和Ho均高于波尔山羊,NEA低于波尔山羊,TNA与NEA的差额、PIC(SD)、Fis(SD)大于波尔山羊,安徽白山羊等位基因的差异程度和多态性高于波尔山羊,遗传结构更丰富,遗传多样性比波尔山羊更高。安徽白山羊对于阜阳地区的生长环境有更强的适应性,在选育方面有很大的潜力。意义:本实验分析了阜阳地区安徽白山羊体重与体尺性状各项指标的相关性和遗传多样性,为建立阜阳地区山羊生产性能标准提供了一定理论依据,为筛选出健康、稳定发育、生产性能高的山羊建立了模型,也验证了阜阳地区安徽白山羊的遗传多样性和适应能力高于波尔山羊,为制定、优化阜阳地区安徽白山羊的保种扩繁策略提供了理论依据。对选育出生产性能更高的安徽白山羊以及规模化养殖模式的开展,具有重要的参考价值、经济价值和研究意义。

二、肉牛群体遗传变异的微卫星多态性分析(论文开题报告)

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

本文主要提出一款精简64位RISC处理器存储管理单元结构并详细分析其设计过程。在该MMU结构中,TLB采用叁个分离的TLB,TLB采用基于内容查找的相联存储器并行查找,支持粗粒度为64KB和细粒度为4KB两种页面大小,采用多级分层页表结构映射地址空间,并详细论述了四级页表转换过程,TLB结构组织等。该MMU结构将作为该处理器存储系统实现的一个重要组成部分。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

三、肉牛群体遗传变异的微卫星多态性分析(论文提纲范文)

(1)基于D-loop序列和SSR的从江田鱼与6个鲤群体的遗传分析(论文提纲范文)

0 引言
1 材料与方法
    1.1 材料
        1.1.1 鲤鱼样本
        1.1.2 仪器设备
        1.1.3 试剂
    1.2 方法
        1.2.1 材料预处理
        1) 基因组DNA的提取与检测。
        2) 线粒体D-loop序列片段的扩增和测序。
        3) 微卫星扩增及基因分型。
        1.2.2 群体遗传分析
2 结果与分析
    2.1 从江田鱼与6个鲤群体的线粒体DNA D-loop序列
    2.2 从江田鱼的微卫星遗传多样性
3 讨论
    3.1 基于线粒体D-loop序列的从江田鱼群体遗传多样性
    3.2 基于线粒体微卫星位点的从江田鱼群体遗传多样性
4 结论

(2)马鹿的起源进化与遗传多样性研究进展(论文提纲范文)

1 马鹿的起源进化
    1.1 马鹿的起源时间
    1.2 马鹿的起源地
    1.3 马鹿的分化与扩散路线
        1.3.1 欧洲马鹿的分化与扩散
        1.3.2 中国马鹿的分化与扩散
2 马鹿的遗传多样性
    2.1 基于常染色体的分子标记
        2.1.1 微卫星标记
        2.1.2 SNP标记
    2.2 母系遗传标记
        2.2.1 Cytb基因
        2.2.2 D-loop区
        2.2.3 12S rRNA和16S rRNA
    2.3 父系遗传标记
        2.3.1 SRY基因
        2.3.2 AMELY基因
        2.3.3 DBY基因
        2.3.4 Usp9y基因
        2.3.5 ZFY基因
3 小 结

(3)基于微卫星标记对长江下游鲢遗传多样性现状的分析(论文提纲范文)

1 材料与方法
    1.1 样品采集
    1.2 DNA提取和PCR
    1.3 遗传多样性参数计算
        1.3.1 微卫星位点多态性
        1.3.2 遗传多样性和遗传分化指数
        1.3.3 遗传结构
2 结果
    2.1 SSR位点多态性
    2.2 群体遗传多样性分析
    2.3 遗传分化水平
    2.4 遗传结构
3 讨论
    3.1 长江下游江段鲢的遗传多样性
    3.2 长江下游江段鲢的遗传分化水平
    3.3 长江下游江段鲢的遗传结构
    3.4 长江下游江段鲢种质资源状况与保护策略
4 结语

(4)郏县红牛的分子育种研究与高效选育(论文提纲范文)

1 郏县红牛种质资源特性与现状
2 郏县红牛分子育种研究
    2.1 郏县红牛分子标记辅助选择研究
    2.2 郏县红牛的比较基因组学研究
    2.3 郏县红牛肉牛的全基因组选择
3 郏县红牛高效选育的实施
    3.1 郏县红牛持续的本品种选育
    3.2 郏县红牛的分子标记辅助选育
4 郏县红牛高效选育的措施
    1)加强领导,建立选育机构
    2)建立良种繁育体系
    3)健全性能测定制度
    4)严格选种选配
    5)科学饲养与合理培育
    6)开展品系繁育
    7)适当导入外血
5 郏县红牛的遗传利用

(5)动物杂种优势利用及其预测方法(论文提纲范文)

1 杂种优势基本概念
2 杂种优势产生的理论
3 杂种优势的利用
4 杂种优势预测方法
    4.1 遗传距离法
    4.2 群间方差与群内方差之比
    4.3 配合力法
    4.4 分子标记法
5 杂种优势预测准确度改善
6 现有问题与展望

(9)基于微卫星标记的7个番鸭群体遗传多样性分析(论文提纲范文)

1 材料与方法
    1.1 实验动物
    1.2 血液采集及DNA提取
    1.3 引物设计及PCR扩增
    1.4数据统计分析
2 结果与分析
    2.1 微卫星位点遗传参数
    2.2群体的遗传多样性
    2.3群体间的遗传距离和系统聚类分析
    2.4 主坐标分析
    2.5 Structure贝叶斯聚类分析
3 讨论
    3.1 24个微卫星位点及7个番鸭群体的遗传多样性
    3.2 7个番鸭群体的遗传距离及其聚类
4 结论

(10)阜阳地区安徽白山羊体重与体尺相关性及其遗传多样性分析(论文提纲范文)

摘要
ABSTRACT
第1章 引言
    1.1 我国肉羊产业发展现状
    1.2 安徽省及阜阳市肉羊产业发展现状
    1.3 阜阳地区肉羊介绍
        1.3.1 阜阳地区饲养的主要肉羊品种
        1.3.2 阜阳地区安徽白山羊的发展现状
    1.4 影响肉羊生产性能的因素
        1.4.1 生产性能和测定性状的选择
        1.4.2 品种对肉羊生产性能的影响
        1.4.3 性别对肉羊生产性能的影响
        1.4.4 月龄对肉羊生产性能的影响
        1.4.5 饲料对肉羊生产性能的影响
        1.4.6 饲喂条件对肉羊生产性能的影响
    1.5 遗传多样性与分子遗传标记技术在山羊育种中的应用
        1.5.1 遗传多样性在山羊育种中的应用
        1.5.2 微卫星标记在山羊育种中的应用
    1.6 研究意义
第2章 材料与方法
    2.1 实验材料
        2.1.1 实验动物
        2.1.2 仪器与设备
        2.1.3 试剂与耗材
        2.1.4 微卫星引物的设计和荧光标记基团的选择
    2.2 实验方法
        2.2.1 生产性能指标数据的采集
        2.2.2 血样的采集
        2.2.3 提取山羊静脉血基因组DNA
        2.2.4 基因组DNA浓度和纯度的检测
        2.2.5 PCR扩增及产物电泳检测
        2.2.6 1%琼脂糖凝胶电泳检测
        2.2.7 数据统计与分析方法
第3章 结果与分析
    3.1 阜阳地区安徽白山羊体重和体尺性状各项指标的相关性分析
        3.1.1 不同月龄安徽白山羊体重和体尺性状各项指标的差异分析
        3.1.2 成年安徽白山羊体重与体尺性状各项指标的相关性分析
        3.1.3 安徽白山羊体重与体尺性状各项指标的相关性分析
    3.2 阜阳地区安徽白山羊遗传多样性分析
        3.2.1 山羊基因组DNA提取与检测结果
        3.2.2 微卫星引物扩增结果
        3.2.3 微卫星DNA位点的遗传变异
        3.2.4 2 个山羊品种群体遗传多样性
        3.2.5 山羊品种群体固定系数的统计
第4章 讨论与结论
    4.1 讨论
        4.1.1 阜阳地区安徽白山羊体重、体尺性状各项指标数据讨论分析
        4.1.2 阜阳地区安徽白山羊体重与体尺性状相关性讨论
        4.1.3 等位基因差异与遗传多样性
        4.1.4 群体遗传分化和群体遗传结构分析
    4.2 结论
第5章 展望
    5.1 阜阳地区山羊生产性能指标标准的验证
    5.2 制定阜阳地区山羊品种资源遗传改良和保护策略
参考文献
附录
致谢
在校期间公开发表刊物及成果情况

四、肉牛群体遗传变异的微卫星多态性分析(论文参考文献)

  • [1]基于D-loop序列和SSR的从江田鱼与6个鲤群体的遗传分析[J]. 张显波,傅建军,胡锦丽,朱文彬,闵倩雯,赵飞,吴俣学,董在杰. 贵州农业科学, 2021
  • [2]马鹿的起源进化与遗传多样性研究进展[J]. 房瑞新,田雪琪,邹晨,董依萌,刘欣,邢秀梅. 中国畜牧兽医, 2021(12)
  • [3]基于微卫星标记对长江下游鲢遗传多样性现状的分析[J]. 罗宇婷,方弟安,周彦锋,徐东坡,彭云鑫,彭飞,张桂宁,刘凯,尤洋. 南方水产科学, 2021
  • [4]郏县红牛的分子育种研究与高效选育[J]. 陈宏,黄永震,雷初朝. 中国牛业科学, 2021(05)
  • [5]动物杂种优势利用及其预测方法[J]. 朱磅强,何俊,曾青华,张跃博. 中国猪业, 2021(04)
  • [6]建昌马和安宁果下马的遗传多样性及7个体高候选基因单核苷酸多态性分析[D]. 刘敏. 西南民族大学, 2021
  • [7]五种商业酵母在贺兰山东麓赤霞珠葡萄酒工业生产中的定殖情况[D]. 何荣荣. 宁夏大学, 2021
  • [8]暗纹东方鲀全基因组微卫星标记的开发及应用[D]. 徐杰杰. 南京师范大学, 2021
  • [9]基于微卫星标记的7个番鸭群体遗传多样性分析[J]. 杨速,操勇清,顾丽红,李丽,曾涛,沈军达,田勇,李国勤,陶争荣,陈黎,毛长国,卢立志. 中国畜牧杂志, 2021(09)
  • [10]阜阳地区安徽白山羊体重与体尺相关性及其遗传多样性分析[D]. 姜馨. 阜阳师范大学, 2021(12)

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肉牛群体遗传变异的微卫星多态性分析
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