一、Phylogenetic Analysis of Drought Responsive ATMYB2 Proteins（论文文献综述）
姚锐,马鑫磊,顾鹏鹏,林小虎,高慧[1]（2022）在《谷子硫解酶基因家族鉴定及表达模式分析》文中研究表明硫解酶（thiolase）是脂肪酸代谢的关键酶,在植物次生代谢合成、生长发育以及抵抗非生物胁迫中均发挥重要作用。为探究谷子硫解酶基因家族的基本特征,本研究利用生物信息学方法,对谷子硫解酶基因家族成员进行了鉴定,对蛋白理化性质及系统进化、基因结构、染色体位置、启动子、基因进化进行了分析;采用转录组测序进行了根、茎、叶、穗组织表达谱分析,运用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）测定干旱胁迫下谷子硫解酶基因家族成员的表达水平。结果表明,谷子硫解酶基因家族共有5个成员,位于4条染色体上,编码的蛋白长度为401～461 aa,分子量为41～49 kDa,均含有硫解酶特有的2个保守基序。系统进化分析显示,谷子硫解酶基因家族分为2个亚家族（KAT和ACAT）,KAT型硫解酶编码基因有14个外显子,ACAT型硫解酶有13个外显子。基因进化分析显示,谷子硫解酶基因既存在功能冗余也存在功能分化。谷子硫解酶编码基因启动子序列中含有光响应、激素类响应、胁迫诱导等多种顺式作用元件。谷子不同组织中硫解酶基因表达谱显示,KAT型硫解酶基因在根、茎、叶、穗部位均高表达;而ACAT型硫解酶基因仅在根和穗部位有较高的表达。干旱胁迫下,谷子硫解酶基因家族成员表达量均明显上调。本研究为揭示谷子硫解酶的功能及其在谷子抗旱育种中的应用提供了理论基础。
周淑倩,陈璐,陈惠云,李永新,陈刚,陆国权,杨虎清[2]（2022）在《甘薯交替氧化酶基因家族生物信息学与表达分析》文中提出为分离甘薯[Ipomoea batatas（L.） Lam.]交替氧化酶（AOX）基因家族成员,分析其在甘薯应答生物和非生物胁迫中的响应模式,本试验在筛选甘薯基因组的基础上,进行基因克隆和测序,最终从心香甘薯中获得3个AOX基因家族成员。基因结构分析结果表明,3个甘薯AOX基因的cDNA全长依次为963、1 080和1 032 bp,分别编码320、359和343个氨基酸,均含4个外显子和3个内含子,将其分别命名为IbAOX1a（GenBank登录号:MT992313）、IbAOX1b（GenBank登录号:MT992314）和IbAOX2 （GenBank登录号:MG450566.1）。蛋白同源性分析结果显示,甘薯AOX蛋白序列在C端十分保守,仅在N端有较小差异,且序列中都存在特有的EXXH、FXHR和EEE-Y铁离子结合保守结构域。亚细胞定位预测结果表明该基因家族成员主要定位在线粒体。蛋白质二级结构预测表明,该基因家族成员主要以α-螺旋、β-转角、延伸链和不规则卷曲为主。实时荧光定量PCR（qRT-PCR）分析结果表明,IbAOXs基因的表达具有组织特异性,IbAOX1a在叶片中表达最高,IbAOX1b和IbAOX2在块根中高表达,IbAOX1a和IbAOX2在花蕾中几乎不表达。IbAOX1a和IbAOX1b在低温、干旱和盐胁迫的幼苗中均表达上调。IbAOX1a在低温块根中的表达高峰显着高于IbAOX1b,而在腐皮镰刀菌（Fusarium solani）侵染的块根中IbAOX1b的表达量显着高于IbAOX1a。无论在甘薯幼苗或块根中,IbAOX2对各种胁迫都没有响应,呈现组成型表达模式。本研究为甘薯AOX基因的功能挖掘及甘薯抗逆品种筛选提供了一定的理论依据。
段强,何智彪,李国瑞,赵秀平,张帅,韩雯毓,陈永胜[3]（2021）在《蓖麻LBD基因家族全基因组鉴定、进化和表达分析》文中认为【目的】探究蓖麻LBD转录因子基因家族的组成和表达模式。【方法】通过生物信息学手段,在全基因组水平上筛选和鉴定蓖麻LBD基因家族成员,并对其基因结构、理化性质、蛋白质保守基序、进化选择压力、系统发育树和基因表达量进行分析。【结果】鉴定得出30个蓖麻LBD基因家族成员在进化过程中高度保守,根据LBD结构域和系统发育树分析的特征,将蓖麻LBD基因家族成员分为Class 1和Class 2两类,各有24个和6个。基因结构与蛋白质保守基序分析表明,蓖麻LBD基因家族成员的基因结构与蛋白质保守基序较为简单;亚细胞定位显示,蓖麻LBD基因家族成员全部定位于细胞核,RcLBD12同时也定位于细胞膜。表达量数据分析表明,在蓖麻中,LBD基因家族成员广泛参与叶、茎、根、胚等的发育调控并响应非生物胁迫。【结论】蓖麻LBD基因家族成员在进化历程中出现了大规模片段复制的情况,经历了较强的纯化选择,并且参与调控蓖麻多个组织部位的生长发育过程,其中RcLBD6与RcLBD27可能在蓖麻抵御非生物胁迫的过程中发挥了重要作用。
刘建光,豆海宽,赵贵元,耿昭,韩硕,安泽彤,张寒霜,王永强[4]（2022）在《海岛棉病程相关蛋白GbPR10基因的克隆及其在干旱胁迫下的功能分析》文中提出病程相关蛋白10 （pathogensis related protein 10, PR10）基因在植物抵御生物胁迫和非生物胁迫过程中起到重要作用。基于本课题组前期干旱胁迫转录组数据,本研究从海岛棉（Gossypium barbadense）’比马90-53’（’Pima90-53’）中克隆得到1个干旱胁迫相关PR10基因,命名为GbPR10 （GenBank No.MT612460）;利用qPCR揭示GbPR10基因的组织表达特异性和外源激素诱导、不同逆境诱导条件下的表达特征;同时克隆并分析GbPR10基因启动子序列特征;构建GbPR10基因的过表达载体PCAMBIA1301-GbPR10转化拟南芥（Arabidopsis thaliana）,分析过表达GbPR10基因拟南芥在干旱胁迫条件下的耐受能力。结果显示GbPR10基因开放阅读框为486 bp,编码161个氨基酸,包含1个Betv1-like结构域,具有Ploop保守结构域,属于病程相关蛋白Betv1家族;组织特异性表达结果表明,GbPR10基因在海岛棉苗期和花铃期的根中优势表达,并受外源脱落酸（abscisic acid, ABA）、乙烯（ethylene, ET）、茉莉酸甲酯（methyl jasmonate, MeJA）和水杨酸（salicylic acid, SA）激素的响应上调表达,在20%聚乙二醇6000 （polyethylene glycol 6000, PEG6000）和200 mmol/L NaCl非生物胁迫下上调表达;通过启动子序列分析克隆并获得了2 176 bp的启动子片段,该序列存在ET和ABA等激素响应元件及多个干旱相关调控元件;过表达GbPR10基因拟南芥在干旱胁迫下根长显着高于野生型（P<0.05）,并且抽薹后植株在自然干旱处理下转GbPR10基因植株的耐旱性显着高于野生型（P<0.05）。由此可见,海岛棉GbPR10基因在棉花应答干旱过程中具有重要作用。本研究为深入研究棉花抗干旱基因的功能机制提供了理论参考。
蔡元保,杨祥燕,庞新华,李季东,林玉虹[5]（2021）在《澳洲坚果MiSTPP3和MiSTPP7基因克隆与表达分析》文中指出以澳洲坚果品种‘O.C.’为试材,利用RT-PCR技术克隆获得2个丝氨酸/苏氨酸磷酸酶基因,分别命名为MiSTPP3和MiSTPP7,其编码序列长度分别为2095 bp和1700 bp。序列分析和系统进化分析表明,MiSTPP3含有MPPPP5C结构域,属于PP5亚家族;MiSTPP7含有MPPPP7结构域,属于PP7亚家族。蛋白理化性质和亚细胞定位分析表明,MiSTPP3是一个稳定的亲水性蛋白,可能定位于质膜;MiSTPP7是一个不稳定的亲水性蛋白,可能定位于线粒体基质。生物信息学分析表明,MiSTPP3和MiSTPP7都是非分泌跨膜蛋白,其二级和三级结构的主要元件都是α螺旋、无规则卷曲和延伸链。RT-qPCR分析表明,MiSTPP3和MiSTPP7在澳洲坚果根、茎、叶、花和小果中都有不同的表达量;MiSTPP3受低温胁迫下调表达,而MiSTPP7上调表达,且二者都受干旱胁迫上调表达。因此,推测MiSTPP3和MiSTPP7可能参与澳洲坚果的生长发育及逆境胁迫反应。
陈妹,吴建阳,张秀梅,邓旭,涂行浩,胡会刚,杜丽清[6]（2021）在《香蕉SPS基因家族的系统进化分析》文中研究表明蔗糖磷酸合成酶（sucrose phosphate synthase, SPS）是调控蔗糖合成途径的关键酶之一,SPS受SPS基因家族编码。本研究基于香蕉基因组数据库,鉴定出3个香蕉SPS基因,分布在4、6、9号染色体上,命名为MaSPS1～MaSPS3基因,其蛋白氨基酸数目在1 043～1 061 aa之间,分子量介于116.36～118.89 kD之间,理论等电点在5.86～6.33之间,均为不稳定的亲水性蛋白,都不存在信号肽,蛋白二级结构都主要由α-螺旋和无规则卷曲组成。Ma SPS1和MaSPS2蛋白主要分布于细胞质,而MaSPS3蛋白主要分布于细胞核,都不存在跨膜结构区。3个MaSPS基因外显子和内含子数量分别为13～14和12～13。3个MaSPS蛋白均有10个相同基序,且都具有糖基转移酶结构域、蔗糖合成酶结构域和蔗糖-6-磷酸磷酸水解酶等3个保守区域。进化树分析发现MaSPS1和Ma SPS3聚类到A亚家族,MaSPS2被聚类到C亚家族。研究结果将为深入研究MaSPS基因的功能及调控香蕉果实发育和成熟过程中糖代谢奠定基础。
刘宇,杨巧,王晓丹,赵春雷,王希,李彦丽,贾海伦,丁广洲,陈丽[7]（2021）在《甜菜BTB蛋白家族的挖掘与生物信息学分析》文中认为BTB（Broad-complex, tramtrack, and bric-à-brac）蛋白在植物生长发育、抗逆性、蛋白质泛素化和降解、细胞骨架组成、离子通道及细胞周期调控等方面发挥着重要作用。本研究从甜菜基因组大数据中获得了49个包含BTB结构域的序列,并利用生物信息学方法对甜菜BTB蛋白家族进行了系统发育、理化性质、基因结构、保守结构域、染色体定位等分析。结果显示:甜菜BTB家族编码的氨基酸大部分都属于酸性氨基酸,氨基酸数目为139～1 120个,翻译的蛋白大部分为亲水性蛋白,可分为9个亚家族（Ankyrin、Armadillo、MATH、NPH3、BACK、TAZ、TPR、BTB-only、Other）,在染色体上呈不均匀分布,主要分布在第5～7号染色体上;亚细胞定位的结果发现36个BTB蛋白都位于细胞核,其余的位于细胞膜和叶绿体上;49个BTB蛋白的磷酸化位点数目为3～25个,不同蛋白磷酸化位点数目差异很大,49个BTB蛋白的等电点为4.70～9.51,分子量为15 848.66～124 344.33 Da;甜菜BTB家族不同亚族的基因结构存在较大差异,不同亚族的内含子数量和长度都不同;预测的二级结构和三级结构结果表明,不同亚家族的二级结构以BTB结构域为主,但不同亚族还包含了不同的结构域;三级结构中不同结构的数量虽存在着差异,但都以α螺旋和β折叠为主。本研究通过对甜菜BTB家族的分析,为阐明甜菜BTB家族基因的功能及其机制奠定基础。
杜婷婷,宋治华,董碧莹,曹红燕,刘腾跃,杨琬珑,祁萌,陈婷,王梦莹,孟冬,杨清,付玉杰[8]（2021）在《木豆类黄酮代谢通路关键基因家族的鉴定与表达分析》文中研究说明黄酮类化合物是植物体内重要的次生代谢产物,在植物生长发育和抵御逆境胁迫中均发挥着重要作用。木豆（Cajanus cajan）是一种生长在喀斯特地域高酸铝土壤的木本豆科先锋树种,富含多种类黄酮等次生代谢物。本研究针对鉴定类黄酮生物合成的关键通路,筛选和鉴定了木豆中8类关键酶基因家族,分别是苯丙氨酸解氨酶（phenylalanine ammonia-lyase, PAL）、肉桂酸4-羟化酶（cinnamic acid-4-hydroxylase, C4H）、4-香豆酸辅酶A连接酶（4-coumarate-CoA ligase, 4CL）、查尔酮合成酶（chalcone synthase, CHS）、查尔酮异构酶（chalcone isomerase, CHI）、黄烷酮-3-羟化酶（flavanone 3-hydroxylase, F3H）、黄酮醇合成酶（flavonol synthase, FLS）、二氢黄酮醇4-还原酶（dihydroflavonol 4-reductase, DFR）,并利用生物信息学软件对其进行了系统发育、基因结构、蛋白结构和启动子顺式作用元件分析以及胁迫条件下的代谢通路基因表达调控分析。系统进化分析显示,PAL、C4H、4CL、CHI基因家族中的部分成员能够与大豆（Glycine max）中的基因聚类在一起,而CHS、FLS、DFR基因家族中仅体现出家族内部成员之间存在序列相似性。蛋白结构分析表明,每个基因家族均含有特殊的保守结构域。启动子顺式作用元件分析结果显示,6类基因家族中含茉莉酸甲酯（MeJA）响应元件的基因占总基因的50%以上。同时,针对木豆的生境特点,本研究对其在铝胁迫和茉莉酸甲酯处理下的8类基因家族进行了RNA-seq分析,结果显示铝胁迫处理下,相对表达量较高的CcPAL2、CcC4H1、CcCHS5～7和CcCHS12均显着上调,而CcCHI4～5和CcFLS7均呈现明显下调趋势,表明铝胁迫下木豆的查尔酮可能积累,推测其可能在抗铝方面发挥一定作用。MeJA处理中,CcC4H1、CcCHS5、CcCHS7、CcCHI4显着上调,而CcF3H下调为对照的0.6倍;同时,下游分支通路中的CcFLS1、CcFLS5、CcFLS6均显着上调,以上结果表明MeJA也可能促进了柚皮素和黄酮醇的积累,推测该物质可能在MeJA信号调控通路中可能发挥着重要作用。以上类黄酮生物合成酶基因在不同阶段的表达变化经qPCR验证与转录组测序结果一致。本研究揭示了类黄酮生物合成关键酶在不同胁迫下的表达模式,为进一步探究查尔酮、黄酮醇等类黄酮物质在逆境胁迫中的调控作用提供参考依据。
袁大双,邓琬玉,王珍,彭茜,张晓莉,姚梦楠,缪文杰,朱冬鸣,李加纳,梁颖[9]（2022）在《甘蓝型油菜BnMAPK2基因的克隆及功能分析》文中研究指明从甘蓝型油菜中分离克隆了BnMAPK2（BnaA01g21880D）基因,cDNA及其编码序列长度分别为1516bp、1113 bp,编码370个氨基酸。生物信息学分析表明, BnMAPK2蛋白分子量为42,497.0 kD,等电点为6.36,蛋白不稳定系数38.74,为疏水性蛋白,具有MAPKs蛋白特有的STKcTEYMAPKplant（cd07858）保守结构域;蛋白二级结构中α螺旋所占比例最大,为44.05%,无信号肽;与拟南芥C族AtMAPK2的亲缘关系更近。核心元件预测结果显示,BnMAPK2-P含有响应水杨酸激素、热胁迫和光照等相关顺式作用元件,包括TCA-element、HSE、AAAC-motif和MYB结合位点等。实时荧光定量PCR （qRT-PCR）结果表明, BnMAPK2在甘蓝型油菜中的各个组织器官中均有表达,受到茉莉酸甲酯、水杨酸、H2O2、损伤、高温和核盘菌的诱导。转基因异源表达BnMAPK2拟南芥株系的表型数据发现,与野生型相比,超量表达BnMAPK2使拟南芥植株的抽薹期提前,株高、主花序有效长度和角果数显着增加,由此推测BnMAPK2基因参与调节植物生长发育过程。本研究为深入探究BnMAPK2调控甘蓝型油菜生长发育过程的分子机制提供了参考资料和数据支撑。
杨盛迪,郭大龙,裴茂松,刘海楠,韦同路,余义和[10]（2021）在《干旱胁迫下葡萄AQP基因家族的鉴定及转录调控网络预测》文中研究表明【目的】探究干旱胁迫下葡萄AQP的转录调控网络,为后续研究葡萄抗旱基因功能和转录调控机制提供理论依据。【方法】通过生物信息学方法分析葡萄AQP基因家族成员的理化性质、系统进化和染色体定位,进行共线性分析和转录因子调控预测,通过转录组数据分析该基因家族在干旱胁迫和脱落酸（abscisic acid,ABA）处理下的表达情况。【结果】37个VvAQP基因主要分为PIP、TIP、NIP、SIP四类,分别分布在17条染色体上,复制分析结果表明,共有5对节段复制和2对串联复制。蛋白序列分析表明,每个VvAQP蛋白序列中均有1个植物AQP主要内在蛋白（major intrinsic proteins,MIP）的保守结构域特征。通过转录调控网络预测发现,靶向VvAQP基因的转录调控因子主要分为16类。干旱胁迫下,根和叶中大部分VvAQP基因表达持续下调,VvPIP2-3、VvPIP2-6在根中持续上调,7个VvAQP基因受ABA显着诱导。干旱胁迫下15个差异表达的转录因子可能与13个VvAQP基因存在调控关系。【结论】鉴定并提供了葡萄AQP基因家族成员的基本信息,通过转录组数据发现可能参与干旱胁迫的VvAQP基因,并预测了这些基因的转录调控网络。
二、Phylogenetic Analysis of Drought Responsive ATMYB2 Proteins（论文开题报告）
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
本文主要提出一款精简64位RISC处理器存储管理单元结构并详细分析其设计过程。在该MMU结构中,TLB采用叁个分离的TLB,TLB采用基于内容查找的相联存储器并行查找,支持粗粒度为64KB和细粒度为4KB两种页面大小,采用多级分层页表结构映射地址空间,并详细论述了四级页表转换过程,TLB结构组织等。该MMU结构将作为该处理器存储系统实现的一个重要组成部分。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
三、Phylogenetic Analysis of Drought Responsive ATMYB2 Proteins（论文提纲范文）
（1）谷子硫解酶基因家族鉴定及表达模式分析（论文提纲范文）
| 1 材料与方法 |
| 1.1 试验材料 |
| 1.2 谷子硫解酶基因家族鉴定 |
| 1.3 谷子近缘植物硫解酶基因家族成员鉴定及系统发育分析 |
| 1.4 谷子硫解酶基因结构和保守结构域分析 |
| 1.5 谷子硫解酶基因家族染色体位置分布 |
| 1.6 谷子、拟南芥、水稻硫解酶蛋白序列比对和催化位点、PTS2位置预测 |
| 1.7 谷子硫解酶基因启动子区顺式作用元件分析 |
| 1.8 谷子硫解酶基因家族成员组织表达特异性分析 |
| 1.9 自然干旱胁迫下谷子硫解酶编码基因实时荧光定量PCR(quanitative real time-PCR, qRT-PCR) |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 谷子硫解酶基因家族鉴定及蛋白理化性质分析 |
| 2.2 硫解酶基因家族系统发育分析、基因结构和保守基序 |
| 2.3 谷子硫解酶编码基因染色体定位和组内、组间共线性分析 |
| 2.4 谷子硫解酶多序列比对 |
| 2.5 谷子硫解酶组织表达特异性 |
| 2.6 谷子硫解酶编码基因启动子区顺式作用元件鉴定和干旱胁迫下表达谱 |
| 3 讨论 |
| 4 结论 |
（2）甘薯交替氧化酶基因家族生物信息学与表达分析（论文提纲范文）
| 1 材料与方法 |
| 1.1 试验材料与试剂 |
| 1.2 甘薯AOX基因家族筛选 |
| 1.3 甘薯AOX基因家族克隆验证 |
| 1.4 甘薯AOX蛋白多重序列比对与系统发育树构建 |
| 1.5 甘薯AOX基因家族生物信息学分析 |
| 1.6 实时荧光定量PCR分析 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 甘薯AOX基因家族克隆鉴定 |
| 2.2 甘薯AOX结构及理化性质分析 |
| 2.3 甘薯AOX蛋白多重序列比对及其进化分析 |
| 2.4 甘薯AOX蛋白Motif序列分析 |
| 2.5 甘薯AOX蛋白二、三级结构预测 |
| 2.6 甘薯AOX基因家族的组织表达特性分析 |
| 2.7 甘薯AOX基因家族在胁迫下的表达分析 |
| 2.7.1 甘薯幼嫩叶片AOX在低温胁迫下的表达分析 |
| 2.7.2 甘薯幼嫩叶片AOX在干旱胁迫下的表达分析 |
| 2.7.3 甘薯幼嫩叶片AOX在高盐胁迫下的表达分析 |
| 2.7.4 甘薯块根AOX在低温胁迫下的表达分析 |
| 2.7.5 腐皮镰刀菌(F. solani)侵染甘薯块根AOX的表达分析 |
| 3 讨论 |
| 4 结论 |
（3）蓖麻LBD基因家族全基因组鉴定、进化和表达分析（论文提纲范文）
| 1 材料和方法 |
| 1.1 材料 |
| 1.2 数据来源 |
| 1.3 蓖麻LBD基因家族成员鉴定及蛋白质理化性质分析 |
| 1.4 蓖麻LBD基因结构、蛋白质保守基序分析 |
| 1.5 蓖麻LBD基因家族染色体定位及复制分析 |
| 1.6 LBD基因家族进化发育分析 |
| 1.7 蓖麻LBD基因家族表达模式分析 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 蓖麻LBD基因家族成员鉴定及蛋白质理化性质分析 |
| 2.2 蓖麻LBD基因结构、蛋白质保守基序分析 |
| 2.3 蓖麻LBD基因家族染色体定位及复制分析 |
| 2.4 LBD基因家族进化发育分析 |
| 2.5 蓖麻LBD基因家族表达模式分析 |
| 3 结论与讨论 |
（4）海岛棉病程相关蛋白GbPR10基因的克隆及其在干旱胁迫下的功能分析（论文提纲范文）
| 1 材料与方法 |
| 1.1 实验材料 |
| 1.2 方法 |
| 1.2.1 棉花培养和激素及聚乙二醇(polyethylene glycol,PEG)、Na Cl胁迫处理 |
| 1.2.2 棉花RNA的提取及c DNA合成 |
| 1.2.3 Gb PR10基因的克隆 |
| 1.2.4 生物信息学分析 |
| 1.2.5 Gb PR10基因实时荧光定量分析 |
| 1.2.6 Gb PR10基因启动子克隆及序列分析 |
| 1.2.7 Gb PR10拟南芥遗传转化及耐旱性分析 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 Gb PR10基因克隆及序列分析 |
| 2.2 Gb PR10基因生物信息学分析 |
| 2.3 Gb PR10组织表达及诱导表达 |
| 2.4 Gb PR10启动子克隆及序列分析 |
| 2.5 转Gb PR10基因拟南芥植株抗旱性分析 |
| 3 讨论 |
| 4 结论 |
（5）澳洲坚果MiSTPP3和MiSTPP7基因克隆与表达分析（论文提纲范文）
| 1 材料与方法 |
| 1.1 材料 |
| 1.2 方法 |
| 1.2.1 MiSTPP3和MiSTPP7基因全长c DNA克隆 |
| 1.2.2蛋白磷酸酶的生物信息学分析 |
| 1.2.3 MiSTPP3和MiSTPP7基因的表达分析 |
| 1.3 数据处理 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 MiSTPP3和MiSTPP7基因的全长序列克隆 |
| 2.2 Mi STPP3和Mi STPP7蛋白氨基酸序列比对 |
| 2.3 MiSTPP3和MiSTPP7与其他蛋白磷酸酶的系统发育分析 |
| 2.4 MiSTPP3和MiSTPP7蛋白的一级结构和理化性质分析 |
| 2.5 MiSTPP3和MiSTPP7蛋白的基本功能分析 |
| 2.6 MiSTPP3和MiSTPP7蛋白的二级和三级结构预测 |
| 2.7 MiSTPP3和MiSTPP7基因的表达分析 |
| 3 讨论 |
（6）香蕉SPS基因家族的系统进化分析（论文提纲范文）
| 1 结果与分析 |
| 1.1 香蕉SPS基因家族全基因组鉴定及编码蛋白基本理化性质分析 |
| 1.2 香蕉SPS基因家族蛋白序列的二级和三级结构分析 |
| 1.3 香蕉SPS基因家族蛋白亚细胞定位分析 |
| 1.4 香蕉SPS基因家族蛋白跨膜结构分析 |
| 1.5 香蕉SPS基因家族染色体定位分析 |
| 1.6 基因共线性分析 |
| 1.7 香蕉SPS家族基因结构和蛋白保守基序分析 |
| 1.8 香蕉SPS基因启动子顺式作用元件分析 |
| 1.9 香蕉SPS基因多序列比对与系统发育分析 |
| 2 讨论 |
| 3 材料与方法 |
| 3.1 供试材料 |
| 3.2 拟南芥和香蕉SPS基因序列获取 |
| 3.3 香蕉SPS基因家族蛋白基本理化性质和信号肽分析 |
| 3.4 香蕉SPS基因家族蛋白疏水性/亲水性分析 |
| 3.5 香蕉SPS基因家族蛋白质二级和三级结构分析 |
| 3.6 香蕉SPS基因家族蛋白亚细胞定位及跨膜结构分析 |
| 3.7 香蕉SPS基因染色体定位与共线性分析 |
| 3.8 香蕉SPS家族保守基序和基因结构分析 |
| 3.9 香蕉SPS基因启动子顺式作用元件分析 |
| 3.1 0 香蕉SPS基因的多序列比对及系统发育分析 |
| 作者贡献 |
（7）甜菜BTB蛋白家族的挖掘与生物信息学分析（论文提纲范文）
| 0 引言 |
| 1 材料与方法 |
| 1.1 甜菜BTB家族基因的挖掘和蛋白的理化性质分析 |
| 1.2 甜菜BTB家族基因的结构分析 |
| 1.3 甜菜BTB蛋白的二级结构和三级结构预测 |
| 1.4 甜菜BTB家族基因的染色体定位分析 |
| 1.5 甜菜BTB蛋白的系统发育分析 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 甜菜BTB蛋白的系统发育分析 |
| 2.2 甜菜BTB蛋白的理化性质分析 |
| 2.3 甜菜BTB家族基因结构分析 |
| 2.4 甜菜BTB蛋白的二级结构与三级结构分析 |
| 2.5 甜菜BTB家族基因染色体定位分析 |
| 3 讨论与结论 |
（8）木豆类黄酮代谢通路关键基因家族的鉴定与表达分析（论文提纲范文）
| 1 材料与方法 |
| 1.1 植物材料 |
| 1.2 蛋白序列鉴定与系统发育分析 |
| 1.3 蛋白结构域、基因结构和顺式作用元件分析 |
| 1.4 铝胁迫和茉莉酸甲酯处理下基因表达分析 |
| 1.5 类黄酮代谢通路关键酶基因表达的q PCR检测分析 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 蛋白序列鉴定与系统发育分析 |
| 2.2 蛋白保守结构域及基因结构分析 |
| 2.3 顺式作用元件分析 |
| 2.4 铝胁迫下的基因表达模式分析 |
| 2.5 Me JA处理下的基因表达模式分析 |
| 3 讨论 |
| 4 结论 |
（9）甘蓝型油菜BnMAPK2基因的克隆及功能分析（论文提纲范文）
| 1 材料与方法 |
| 1.1 试验材料 |
| 1.2 甘蓝型油菜Bn MAPK2基因c DNA克隆 |
| 1.3 Bn MAPK2启动子克隆 |
| 1.4 Bn MAPK2基因生物信息学分析 |
| 1.5 Bn MAPK2基因组织特异性 |
| 1.6 Bn MAPK2基因表达模式分析 |
| 1.7 超量表达遗传转化载体的构建 |
| 1.8 拟南芥的栽培及遗传转化 |
| 1.9 转基因拟南芥的表型考察 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 Bn MAPK2基因的克隆 |
| 2.2 Bn MAPK2启动子的克隆和序列分析 |
| 2.3 Bn MAPK2基因的生物信息学分析 |
| 2.3.1 Bn MAPK2序列及进化关系分析 |
| 2.3.2 Bn MAPK2蛋白质结构分析 |
| 2.4 Bn MAPK2基因的表达模式分析 |
| 2.4.1 甘蓝型油菜Bn MAPK2基因的组织特异性分析 |
| 2.4.2 甘蓝型油菜Bn MAPK2基因的诱导表达分析 |
| 2.5 Bn MAPK2转基因拟南芥植株的获得 |
| 2.6 Bn MAPK2基因对拟南芥生长发育的影响 |
| 2.6.1 Bn MAPK2对拟南芥苗期和蕾薹期的影响 |
| 2.6.2 Bn MAPK2对拟南芥成熟期生长的影响 |
| 2.6.3 Bn MAPK2对拟南芥产量性状的影响 |
| 3 讨论 |
| 4 结论 |
（10）干旱胁迫下葡萄AQP基因家族的鉴定及转录调控网络预测（论文提纲范文）
| 1 材料和方法 |
| 1.1 Vv AQP家族成员的获取及进化树构建 |
| 1.2 Vv AQP基因家族的生物信息学分析 |
| 1.3 干旱胁迫和外源施加ABA对葡萄根和叶中AQP基因表达模式的影响 |
| 1.4 靶向葡萄AQP基因的转录因子调控预测 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 葡萄基因组AQP基因家族成员鉴定和蛋白质理化性质分析 |
| 2.2 Vv AQP基因的染色体定位分析和复制分析 |
| 2.3 Vv AQP基因家族的系统发育、保守结构域、保守基序、基因结构分析 |
| 2.4 AQP基因的多物种共线性分析 |
| 2.5 Vv AQP基因在干旱胁迫、ABA处理下的表达模式 |
| 2.6 靶向Vv AQP基因的转录因子调控预测分析 |
| 2.7 差异转录因子的表达趋势分析 |
| 2.8 靶向AQP基因的候选转录因子调控位点预测 |
| 3 讨论 |
| 4 结论 |
四、Phylogenetic Analysis of Drought Responsive ATMYB2 Proteins（论文参考文献）
- [1]谷子硫解酶基因家族鉴定及表达模式分析[J]. 姚锐,马鑫磊,顾鹏鹏,林小虎,高慧. 核农学报, 2022
- [2]甘薯交替氧化酶基因家族生物信息学与表达分析[J]. 周淑倩,陈璐,陈惠云,李永新,陈刚,陆国权,杨虎清. 核农学报, 2022
- [3]蓖麻LBD基因家族全基因组鉴定、进化和表达分析[J]. 段强,何智彪,李国瑞,赵秀平,张帅,韩雯毓,陈永胜. 北方农业学报, 2021(06)
- [4]海岛棉病程相关蛋白GbPR10基因的克隆及其在干旱胁迫下的功能分析[J]. 刘建光,豆海宽,赵贵元,耿昭,韩硕,安泽彤,张寒霜,王永强. 农业生物技术学报, 2022
- [5]澳洲坚果MiSTPP3和MiSTPP7基因克隆与表达分析[J]. 蔡元保,杨祥燕,庞新华,李季东,林玉虹. 热带作物学报, 2021
- [6]香蕉SPS基因家族的系统进化分析[J]. 陈妹,吴建阳,张秀梅,邓旭,涂行浩,胡会刚,杜丽清. 分子植物育种, 2021(19)
- [7]甜菜BTB蛋白家族的挖掘与生物信息学分析[J]. 刘宇,杨巧,王晓丹,赵春雷,王希,李彦丽,贾海伦,丁广洲,陈丽. 中国糖料, 2021(04)
- [8]木豆类黄酮代谢通路关键基因家族的鉴定与表达分析[J]. 杜婷婷,宋治华,董碧莹,曹红燕,刘腾跃,杨琬珑,祁萌,陈婷,王梦莹,孟冬,杨清,付玉杰. 农业生物技术学报, 2021(12)
- [9]甘蓝型油菜BnMAPK2基因的克隆及功能分析[J]. 袁大双,邓琬玉,王珍,彭茜,张晓莉,姚梦楠,缪文杰,朱冬鸣,李加纳,梁颖. 作物学报, 2022(04)
- [10]干旱胁迫下葡萄AQP基因家族的鉴定及转录调控网络预测[J]. 杨盛迪,郭大龙,裴茂松,刘海楠,韦同路,余义和. 果树学报, 2021(10)